In Var Commons wordt wonderkind Sorata terug in de tijd geslingerd naar een mysterieus schip met drie jonge vrouwen en acht andere mannen op avontuur om de geheimen van Norn te ontrafelen! Last Era zet de avonturen van het team voort in drie spannende delen.

- Prelude: bevat de achtergrondverhalen van hoe iedereen op het schip terechtkwam
- Fuga: de originele samenvatting van het spel
- Concerto: het naverhaal
- Fantasia: de bonus - waar iedereen een chibi wordt! Om weer op ware grootte te komen, moet je een speciale missie voltooien!